主讲人：吴凌云（中科院数学与系统科学研究院研究员）

邀请人：卓新建

时  间：2018年10月23日(周二)  15:00-16:00

地  点：主楼1214

报告摘要：

Since the concept of network-based biomarker has been proposed in last decade, a lot of models and algorithms have been developed for identifying network-based biomarkers. The idea of PageRank, the famous web page ranking algorithm used by Google, was successfully applied to biomarker identification. In this study, we proposed a novel PageRank-like method called MarkRank, which incorporates both PPI network and gene expression data to identify biomarkers. The major advantage of MarkRank is that the combinatoric effect of genes is considered and explicitly modeled. MarkRank outperforms the existing PageRank-based method NetRank in several real cancer datasets.

报告人简介：

吴凌云，中国科学院数学与系统科学研究院研究员，博士生导师，应用数学所所长助理，生物信息学研究中心主任。中国运筹学会常务理事，科普工作委员会副主任，青年工作委员会副主任，计算系统生物学分会副理事长。2002年于中国科学院数学与系统科学研究院获运筹学与控制论专业理学博士学位。曾在香港科技大学和美国康奈尔大学Weill医学院从事博士后研究工作。目前的研究兴趣是运筹学与信息科学，特别是运筹学在生物信息学与系统生物学中的应用、运筹学在物流与金融科技中的应用。主要工作包括： DNA测序算法，蛋白质结构比对算法，分子生物网络比对算法，复杂疾病生物标记识别方法，无人仓最优入库与拣选策略等。主持过青年基金，面上基金，重大研究计划培育项目等多项国家自然科学基金，2014年获中国运筹学会青年科技奖。